A taxonomia bacteriana é a taxonomia utilizada na classificação bacteriana. Trata-se de uma taxonomia lineana, ou seja, uma classificação baseada na hierarquia atribuída aos diferentes taxons de bactérias. Na classificação científica estabelecida por Carl von Linné, Cada espécie é atribuída a um género (nomenclatura binomial), que por sua vez possui uma hierarquia inferior à de outras categorias superiores, que são sucessivamente: família, subordem, ordem, subclasse, classe, divisão/filo, reino e domínio. Na classificação biológica actualmente aceite dos seres vivos distinguem-se três domínios: Eukaryota, Bacteria e Archaea. que, em termos taxonómicos, apesar de seguirem os mesmos princípios, utilizam convenções diferentes entre si e entre as suas subdivisões, que são estudadas por diferentes disciplinas (Botânica, Zoologia, Micologia e Microbiologia); por exemplo, em Zoologia existem espécimes-tipo, enquanto que em Microbiologia existem estirpes-tipo.
Diversidade
Os procariontes partilham muitas características comuns, como a ausência de membrana nuclear, unicelularidade, divisão por fissão binária e tamanho geralmente pequeno. As espécies diferem entre si em algumas características que permitem a sua classificação. As características mais importantes são:
Filogenia: Todas as bactérias derivam de um antepassado comum e diversificaram-se a partir dele, pelo que apresentam diferentes níveis de parentesco evolutivo. Metabolismo: Diferentes bactérias possuem diferentes capacidades metabólicas. Ambiente: Diferentes espécies prosperam em determinados ambientes, como temperaturas altas ou baixas, altas concentrações de sal, etc. (ver extremófilos) Morfologia: Existem muitas diferenças estruturais entre as bactérias, como a forma da célula, a coloração de Gram (número de bicamadas lipídicas) ou a composição das camadas. Patogenicidade: Algumas bactérias são patogénicas para as plantas e animais.
História da classificação As bactérias foram observadas pela primeira vez por Antoni van Leeuwenhoek em 1676, utilizando um microscópio simples que ele próprio construiu. Chamou aos microrganismos que observou "animálculos" e publicou as suas observações numa série de cartas enviadas à Royal Society de Londres. O nome "bactéria" só foi introduzido mais tarde por Christian Gottfried Ehrenberg em 1838.
Classificação clássica
Situação entre os seres vivos
Inicialmente, as bactérias foram classificadas como plantass, formando a classe Schizomycetes, que, juntamente com as Schizophyceae (algas verde-azuladas/Cyanobacteria), formaram o filo Schizophyta. Em 1866, Ernst Haeckel classificou o grupo no filo Monera (em alemão, do grego μονήρης, simples), pertencente ao reino Protista, e definiu-os como organismos homogéneos sem qualquer estrutura, constituídos apenas por uma porção de plasma. Haeckel subdividiu o filo em dois grupos:
Gymnomoneren (sem o invólucro). Entre estes, os principais grupos que se destacaram foram: Protogenes — como Protogenes primordialis, agora classificado como eukaryotes e não como bactéria. Protamoeba — agora classificado como eucariota. Vibrio — um género de bactérias em forma de vírgula descrito em 1854.) Bacterium — um género de bactérias em forma de bastonete descrito em 1828, que mais tarde daria o nome a todos os membros do género Monera (em alemão, Haeckel dizia Moneren no singular e Moneres no plural feminino). Bacillus — um género de bactérias em forma de bastonete, formadoras de esporos, descrito em 1835. Spirochaeta — bactérias muito finas em forma de espiral descritas em 1835. Spirillum — bactéria espiral descrita em 1832. Lepomoneren (envelopados). Entre eles estavam: Protomonas — agora classificado como eucariota. O nome foi reutilizado em 1984 para um género de bactérias não relacionado. Vampyrella — hoje considerada eucariótica. O grupo foi posteriormente reclassificado como Procariontess por Chatton. É importante notar que na classificação das cianobactérias (vulgarmente conhecidas como "algas verde-azuladas") houve uma disputa entre considerá-las algas ou bactérias (por exemplo, Haeckel classificou o género Nostoc no filo Archephyta das algas). Em 1905, Erwin F. Smith aceitou 33 nomes válidos para géneros bacterianos e cerca de 150 inválidos. e em 1913 Vuillemin um estudo concluiu que todas as espécies de bactérias podiam ser distribuídas pelos seguintes géneros: Planococcus, Streptococcus, Klebsiella, Merista, Planomerista, Neisseria, Sarcina, Planosarcina, Metabacterium, Clostridium, Serratia, Bacterium e Spirillum. No entanto, diferentes autores reclassificaram frequentemente os géneros devido à falta de características visíveis que os orientassem, resultando numa situação caótica que foi resumida em 1915 por [autor não especificado]. Robert Earle Buchanan Nessa altura, todo o grupo recebeu diferentes patentes e nomes, segundo o autor, principalmente os seguintes:
Schizomycetes (Naegeli 1857) Bacteriaceae (Cohn 1872,) Bacteria (Cohn 1872b,) Schizomycetaceae (DeToni e Trevisan 1889,) Além disso, as famílias em que as classes foram divididas foram subdivididas e variaram de autor para autor, e alguns usaram nomes em alemão em vez de latim. A primeira edição do Código Bacteriológico de 1947 resolveu alguns destes problemas. Predefinição:Classificação biológica dos reinos
Subdivisões baseadas na coloração de Gram Embora exista pouco consenso sobre a subdivisão das "Bactérias" em subgrupos, a coloração de Gram foi amplamente utilizada como ferramenta de classificação e, consequentemente, até ao advento da filogenia molecular, o reino dos "Procariontes" foi dividido em quatro divisões, Um esquema de classificação ainda formalmente seguido pelo Manual de Bacteriologia Sistemática de Bergey para a ordem de volume.
Gracilicutes (gramnegativas) Photobacteria (fotossintéticas): classe Oxyphotobacteriae (utiliza a água como dadora de electrões), inclui a ordem Cyanobacteriales = algas verde-azuladas, agora filo Cyanobacteria) e a classe Anoxyphotobacteriae (fototróficas anaeróbias, ordens: Rhodospirillales e Chlorobiales) Scotobacteria (não fotossintéticas, agora designadas por Proteobacteria e outros filos Gram-negativos não fotossintéticos) Firmacutes [sic] (grampositivos, mais tarde designadas por Firmicutes) (fotossintéticas): classe Oxyphotobacteriae (utiliza a água como dadora de electrões), inclui a ordem Cyanobacteriales = algas verde-azuladas, agora filo Cyanobacteria) e a classe Anoxyphotobacteriae (fototróficas anaeróbias, ordens: Rhodospirillales e Chlorobiales)
Scotobacteria (não fotossintéticas, agora designadas por Proteobacteria e outros filos Gram-negativos não fotossintéticos) Firmacutes [sic] (grampositivos, mais tarde designadas por Firmicutes
Referências